Issue d'une famille de musiciens, Lusine Khachatryan reçoit dès l'âge de six ans ses premiers cours de piano, par sa mère Irina Hovhannisyan, musicienne diplômée; par la suite, elle entra à l'école de musique "Sayat-Nova" à Erivan (Arménie) dans la classe de H. Ancharakyan. Après l´installation de la famille en Allemagne en 1992, ce sera son père Vladimir Khachatryan, également musicien diplômé, qui s'occupera de la suite de la formation musicale de la jeune artiste.
De 2001 à 2008, Lusine Khachatryan étudie à l'école supérieure de musique de Karlsruhe et y obtient un double diplôme de Master : de piano dans la classe du Prof. S. Speidel, et de musique de chambre dans la classe du Prof. Dr. S.Tatubeava.
