Lusine Khachatryan se produit également en duo avec son frère, le prestigieux violoniste, Sergey Khachatryan, avec qui elle a enregistré, en 2002, le CD " Début" chez EMI Classics, puis en 2007, les sonates pour piano et violon de C. Franck et de D. Schostakowitsch, CD paru chez Naïve.
